Boa noite Ferumbraas!

Primeiramente, qual modelo EXATO do seu notebook? 

Antes de lhe passar algumas informações, vou responder sua questão...
Sim, você irá perder a garantia.

Você não perde garantia de hardware por abrir seu equipamento para realizar um upgrade, contato que no processo não danifique nenhum componente ou parte do aparelho nem rompa nenhum lacre interno.

No HDD original de sua máquina existe a partição de recuperação do Windows criada pela Acer.
Durante o período vigente de garantia de software, essa partição não deve ser apagada nem danificada.
Se ela for danificada ou apagada você irá perder a garantia de software (que é diferente da garantia de hardware).
Caso opte por instalar um SSD realente, você pode clonar o Windows 10 e sua partições, até mesmo para manter acesso ao sistema OEM.
Para isso, o espaço do SSD deve ser do mesmo tamanho do HDD e deverá alinhar as partições.
Pode utilizar algum software de clonagem como o Minitool Partition, Macrium Reflect ou EaseUS. 

Lembrando que caso precise acionar a garantia em algum momento, voce deverá remover todos os hardwares instalados e recolocar todos que forem removidos e realizar backup dos seus dados.