Якщо ви спробуєте використовувати програму, яка недоступна в Windows Store, ви побачите нагадування, що програми, які використовуються в Windows 10 S, мають надходити з Windows Store. У деяких випадках ви також можете побачити пропозицію щодо категорії подібних програм або певної програми, яка вже доступна в Windows Store. Зауважте, що деякі інструменти розробника не підтримуватимуться для використання в Windows 10 S, а невелика кількість програм з відомими проблемами сумісності отримають повідомлення про проблему, включену на сторінку інформації про програму в Windows Store. Зрештою, якщо ви хочете завантажити програму, якої немає в Windows Store або має проблеми з сумісністю, ви можете змінити конфігурацію Windows 10 S на Windows 10 Pro.