Nếu bạn cố gắng sử dụng một ứng dụng không có sẵn trong Cửa hàng Windows, bạn sẽ thấy một thông báo nhắc nhở rằng các ứng dụng được sử dụng với Windows 10 S phải được tải xuống từ Cửa hàng Windows. Trong một số trường hợp, bạn cũng có thể thấy đề xuất về một danh mục các ứng dụng tương tự hoặc một ứng dụng cụ thể đã có sẵn trong Cửa hàng Windows. Windows Lưu ý rằng một số công cụ phát triển sẽ không được hỗ trợ sử dụng trên Windows 10 S và một số ít ứng dụng có vấn đề tương thích đã biết sẽ có thông báo về vấn đề này được bao gồm trong trang chi tiết sản phẩm của ứng dụng trong Windows Store. Cuối cùng, nếu bạn muốn tải xuống một ứng dụng không có trong Windows Store hoặc có vấn đề tương thích, bạn có thể chọn chuyển sang cấu hình Windows 10 Pro.