Windows 10 S pracuje wyłącznie ze zgodnymi aplikacjami ze sklepu Windows. Zdecydowana większość dostępnych aplikacji w Sklepie Windows będzie działać na Windows 10 S w taki sam sposób będą one działać na Windows 10 Pro i Windows 10 Home. Uwaga! Niektóre narzędzia deweloperskie nie będą obsługiwane w Windows 10 S oraz w niewielkiej liczbie aplikacji, w których są znane problemy ze zgodnością, pojawi się informacja o problemach na stronie szczegółów produktu aplikacji w Sklepie Windows.
Liczne akcesoria i urządzenia peryferyjne (np. drukarki), które działają z systemem Windows 10 będą działać w systemie Windows 10 S, ale mogą mieć ograniczoną funkcjonalność. Ta strona Microsoft® ma kilka dodatkowych szczegółów dla akcesorii oraz sprzętu firmy Microsoft, a także linki do stron firm trzecich, które mogą udostępniać informacje o zgodności ich akcesorii z Windows 10 S. Jeśli nie znajdziesz informacji dotyczących konkretnego modelu, skontaktuj się z producentem akcesorium bezpośrednio.