Se si tenta di utilizzare un'app che non è disponibile in Windows Store, si vedrà un promemoria indicante che le applicazioni utilizzate con Windows 10 S devono provenire da Windows Store. In alcuni casi, si può visualizzare anche un suggerimento per una categoria di applicazioni simili o una specifica applicazione che è già disponibile in Windows Store. Si noti che alcuni strumenti di sviluppo non saranno supportati per l'utilizzo su Windows 10 S e un piccolo numero di applicazioni con problemi di compatibilità noti avranno preavviso del problema incluso in Windows Store nella pagina di dettaglio del prodotto dell'applicazione. In definitiva, se si desidera scaricare un'applicazione che non è in Windows Store o ha problemi di compatibilità, è possibile scegliere di passare dalla configurazione di Windows 10 S a Windows Pro 10.
