Windows 10 S bekerja secara eksklusif dengan aplikasi yang kompatibel dari Windows Store. Sebagian besar aplikasi yang tersedia di Windows Store akan bekerja pada Windows 10 S dengan cara yang sama seperti pada Windows 10 Pro dan Windows 10 Home. Perhatikan bahwa beberapa alat pengembang tidak akan didukung untuk digunakan pada Windows 10 S dan sejumlah kecil aplikasi dengan masalah kompatibilitas yang diketahui akan memiliki pemberitahuan tentang masalah tersebut yang disertakan dalam halaman detail produk aplikasi di Windows Store.
Banyak aksesori dan periferal perangkat keras (seperti printer) yang dapat digunakan dengan Windows 10 saat ini dapat digunakan dengan Windows 10 S, namun mungkin memiliki fungsi yang terbatas. Halaman Microsoft® ini memiliki beberapa rincian tambahan tentang aksesori perangkat keras Microsoft serta tautan ke pihak ketiga yang dapat berbagi informasi kompatibilitas untuk menggunakan aksesori mereka dengan Windows 10 S. Jika Anda tidak menemukan informasi tentang model tertentu, hubungi produsen aksesori Anda secara langsung.